中間取樣裝置為了測量凍干過程的某些參數（如含水量），以研究這些參數在凍干過程中的變化情況，或為獲取原始數據制定凍于曲線，往往需要將正在凍干的制品從凍干箱中取出進行分析。許多凍干機供應商在實驗用凍干機、甚至生產用凍干機（可選擇訂貨）的箱門上，裝備有中間取樣裝置。

不同廣商提供的中間取樣裝置的形式各不相同，但其結構原理都差不多，圖6-18示出了一種中間取樣裝置及其結構示意圖，該裝置安裝在凍干箱的箱門上。

凍干時取樣密封門6關閉，需要取樣時，取樣爪3伸人凍干箱內夾取制品瓶，并拖至壓塞器2下面，用壓塞器將瓶塞壓緊，再拖至真空閥5上方松開，樣品掉人取樣室內，關緊真空閥5，打開放空氣閥8，待取樣室壓力達到大氣壓后，打開取樣密封門，可將樣品取出。而后關閉放空氣閥8和取樣密封門6，又可進行下一次取樣。