氣調庫的主體建筑物包括氣調儲藏間、挑選間、預冷間、穿堂、月臺和技術走廊。氣調庫以單層建筑為主。主體建筑從外形上看是一個完整的建筑，內部按生產工藝流程和物流方向分刻，其中挑選間也可以作為配套建筑單獨設置。

挑選間對氣調庫而言是十分必要的。果蔬進出庫前都要在共中挑選、分級、裝箱、稱重，同時它也是果蔬出入庫前的臨時堆放場所。挑選間通常緊靠氣調庫設置，與庫內穿堂相通。挑選間應該具有良好的采光和通風條件，地面可以沖洗，并有排水措施。

預冷間是為果蔬儲藏前的預先冷卻而設置的。在預冷間果蔬的溫度可以迅速降低，待接近或達到儲藏溫度后，再移入氣調間儲藏。這樣，可以避免將大量的田間熱帶入氣調間，而且可以降低氣調間所需配置的制冷機負荷。預冷間只需隔熱而不必氣密。

穿堂是果蔬進出氣調庫的通道，也是聯系各氣調間的樞紐。為保證冷藏鏈的完善，同時防止果蔬出貨時結露使貨架期縮短，氣調庫一般設置低溫穿堂。穿堂中有制冷設備，溫度一般控制在7一10℃。當然，穿堂也只需隔熱而不必氣密。

月臺供進出貨裝卸用。根據氣調庫的儲藏量確定月臺的長、寬。一般容量小于1 500 t的氣調庫，月臺長度為10-30 m，寬為5--7m。月臺的高度應與運送果蔬的主要型號車輛的廂底高度一致。若經濟條件允許，可建造升降式月臺和滑升門，并將月臺溫度控制在7~10℃，保證冷藏樁的連續性，與國際接執。月臺無氣密要求。

技術走廊通常設在穿堂的樓上，作為操作管理人員在儲藏期間觀察果蔬的儲藏情況和庫內設備運行狀況之用，同是它也是制冷、氣調、水電等管線安裝、操作和維修的場所。對于分散式制冷方案的氣調庫，還可以將制冷設備安裝在技術走廊內，以節省機房的占地面積，還可以使制冷的管道長度大大縮短。