降低氧或提高二氧化碳濃度能夠降低蘋果和梨的呼吸強度并推遲呼吸高峰的出現。氧對呼吸強度的抑制必須下降到7%以下濃度時，才能起作用，但是不宜低于2%，否則易出現中毒現象。二氧化碳對呼吸的抑制作用則是濃度愈高，抑制作用愈強，有人測定在5%濃度中呼吸強度下降到70%。如果環境中同時降氧和升高二氧化碳濃度，抑制作用將更為顯著，例如在5%氧和5%二氧化碳濃度組合中，蘋果呼吸強度會下降到38%。不同二氧化碳和氧濃度配比條件對蔬菜水果的呼吸作用抑制程度不同。

但是二氧化碳濃度過高或氧濃度過低都會導致生理病變。如果二氧化碳濃度過高，會致使大量琥珀酸積累，導致果肉褐變、黑心等生理病害發生，其嚴重程度與果實的成熟度、儲藏溫度、儲藏期、高二氧化碳濃度施加時間長短以及空氣成分組成(O2,CO2,C2H4含量等)有關。如果氧濃度過低，會致使乙醇、乙醛等有害物質積累，伴有嚴重的酒精味出現，導致果實腐爛。各種蔬菜水果對高二氧化碳和低氧濃度都有一定的適應性，對極端濃度的忍耐度也各不相同。